2016年全国交通运输工作会议上，交通运输部部长杨传堂作了题为《坚持五大发展理念推进结构性改革为全面建成小康社会当好先行》的报告。到2020年基本建成安全便捷、畅通高效、绿色智能的现代综合交通运输体系，水运业也将呈现新的发展趋势。
“十三五”
落实五大发展理念
从发展机遇看，到2020年实现全面小康，我国经济必须保持年均6.5%以上的中高速增长，经济稳增长任务繁重，交通运输仍需要继续发挥有效投资对冲经济下行压力的关键作用。“十三五”时期，交通投资规模仍将高位运行，货运量也将中高速增长。“互联网+交通运输”深入实施，新模式、新业态、新动能不断涌现，为交通运输转型升级注入了强大动力。国家在建设用地、环评审批方面下放审批权限，简政放权等改革举措将进一步激发市场活力。
推进“五个更加注重”
更加注重补齐交通基础设施短板，打通“最后一公里”，加快建成综合交通基础设施网络，提高网络化水平和运行效率。
更加注重扩大更加经济、高效的多式联运货运服务供给，提升服务的集约化规模化水平。
更加注重运输装备提档升级，推进货运车型、船型及多式联运等装备设施标准化，积极发展新能源和清洁能源运输装备，引导高端化、智能化的先进运输装备推广应用。
更加注重各种运输方式协调发展，发挥铁路运输和水运在大宗货运中的比较优势，大力发展多式联运，提高中转效率，降低运输成本。
更加注重推进放权降费，发挥市场在资源配置中的决定性作用和更好发挥政府作用，加快放开交通运输领域竞争性环节价格，降低重要运输环节费用。
落实五大发展理念
第一，坚持创新发展，培育交通运输发展的新动力。以推动综合交通运输体系深度融合、协同发展为主攻方向。释放新需求，创造新供给，以科技创新引领交通运输的全面创新。
第二，坚持协调发展，形成交通运输平衡发展的新格局。促进综合运输体系内部协调，发挥各种运输方式比较优势，补齐中西部铁路和内河水运的短板，推动多式联运发展，实现各种运输方式之间的合理分工、有效协作和一体化服务。
第三，坚持绿色发展，探索交通运输可持续发展的新模式。改变不合理运输分担方式，充分发挥铁路和水运运能大、能耗低的技术优势。推动多式联运和甩挂运输发展。
第四，坚持开放发展，开拓交通运输发展的新空间。加快大通道建设，开辟多式联运跨境交通走廊，提升对“一带一路”战略的支撑力。推动交通运输“走出去”，培育具有国际竞争力的交通运输大企业。
第五，坚持共享发展，让人民群众共享交通运输发展的新成果。
“十三五”
三大发展思路
“十三五”期间综合交通运输发展的总体目标是：加快推进综合交通、智慧交通、绿色交通、平安交通建设，加快完善综合交通基础设施网络，到2020年基本建成安全便捷、畅通高效、绿色智能的现代综合交通运输体系。
大力发展多式联运
加快物流大通道建设，加强货运枢纽（物流园区）和集疏运体系建设，推动运载工具、转运装备标准化和信息规则流程票制的标准统一，推进甩挂运输全面发展，促进铁水联运、江海联运升级发展，统筹城乡配送协调发展，健全城乡物流网络，发展第三方物流，促进快递“上车上船上机”，不断提升货运效率，降低货运成本。强化主要港口战略支点作用，加强南海岛礁灯塔建设，增强远洋运输国际竞争力，提高原油、粮食等重要战略物资承运保障能力，促进海运业健康发展。
推进智慧绿色平安交通建设
准确把握世界科技发展趋势和交通运输发展需求，充分发挥科技创新在建设智慧绿色平安交通中的引领作用。
联通道路、畅通水路、优化航路
从注重沿海对外开放向全面对外开放转变，加强内陆沿边地区口岸和交通基础设施建设，开辟跨境多式联运交通走廊；从注重引进向推进双向开放转变，全面实行准入前国民待遇加负面清单管理制度。积极服务“一带一路”战略，加快口岸基础设施建设和港口合作建设，促进国际运输便利化，推动形成国际物流大通道，逐步形成连接亚洲各次区域以及亚欧非之间的交通基础设施网络和安全高效的陆海空通道网络。
“十三五”
开局之年六大重点
2016年是“十三五”开局之年，也是推进结构性改革的攻坚之年，要坚持稳中求进的工作总基调，切实加强供给侧结构性改革，全力当好经济社会发展先行官，实现“十三五”发展的良好开局。
简政放权完善市场
研究制定部权力和责任清单。落实《关于深化交通运输基础设施投融资改革的指导意见》，全面推进交通设施建设PPP模式，探索专项债券、政策性贷款、股权融资等融资新模式，探索设立交通运输发展基金。推动公路水路领域事权与支出责任划分。
完善市场准入与退出制度，推进竞争性领域环节价格改革，深化港口收费改革，落实《港口收费计费办法》，继续清理规范涉企收费。
加快法治建设
加快《海上交通安全法》修订，加快制定《航道法》配套法规和《船舶登记办法》等重点规章，评估《港口法》实施效果。继续推进公路、水运建设工程围标串标、工程设计违规变更和沿海港口工程未批先建等突出问题专项治理。
支撑国家“三大战略”
依托沿海港口，拓展国际运输网络。推进京津冀交通一体化取得新突破，加快推进长江经济带综合立体交通走廊建设，制定《长江经济带发展规划纲要交通运输实施方案》，组织实施好《推进长江航运科学发展的若干意见》，加快实施长江南京以下12.5米深水航道二期工程等一批重大项目，组织做好三峡枢纽水运新通道航道关键技术研究，推进沿江港口转型升级。
建设海运强国
落实好老旧运输船舶和单壳油轮提前报废更新政策。加快推进港口转型升级，大力发展现代航运服务业，继续推进全国内河船型标准化。严格履行《2006年海事劳工公约》，切实保护船员合法权益。
推动《国家水上交通安全监管和救助系统布局规划》实施，推进《全国沿海港口布局规划》修编。全面加快“两横一纵两网十八线”内河高等级航道和内河主要港口建设。有序推进沿海大型规模化港区和专业化码头建设，实施上海国际航运中心洋山港区四期等一批重点工程。支持珠江水运发展高层协调等工作机制发挥积极作用。着力提升主要港口集疏运通道建设和服务水平，完善铁路进港“最后一公里”。贯彻落实《航道法》，加强长江干线等高等级航道养护和航道资源保护。
运输服务提质增效
联合发展改革委组织实施首批多式联运示范工程，重点推进集装箱铁水、公铁联运发展。深化铁水集装箱联运试点工程，启动实施货运车型和设施装备标准化工作，推广甩挂运输试点经验和依托互联网平台的“无车承运人”发展模式。
发展绿色航运
加快推进LNG等清洁能源应用，鼓励船舶靠港使用岸电。
推进实施《船舶与港口污染防治专项行动实施方案（2015-2020）》，率先试行珠三角、长三角、环渤海（京津冀）水域船舶排放控制区。
开展原油成品油码头油气回收试点工作，推动船舶污染物接收处置设施建设。统筹利用综合运输线位、运输枢纽、跨江跨海通道线位等资源，提高建设用地和港口岸线的利用效率。
